소울 테이커 우스케는 어머니와 단둘이 살아가는 평범한 소년이었지만 끔찍한 사건을 겪으면서 어머니와 헤어져 혼수 상태에 빠진다. 미사키 마야라는 수수께끼의 소녀는 이런 쿄우스케를 구해 자신의 집으로 데려간다. 그곳에서 정신을 차린 쿄우스케는 그녀의 도움으로 체력을 회복해 가지만 이번에는 마야가 정체불명에 집단에게 납치된다.그녀를 구하러 가던 쿄우스케는 자신을 가로막는 의사를 만난다. 위기의 순간에 다시 미부 시로라는 남자에게 도움을 받은 쿄우스케. 그러나 그가 왜 자신을 도와주었는지에 대해서는 알 수가 없었다. 마침내 쿄우스케와 시로는 마야를…